研究

中國傳統醫學研究院的研究涵蓋整個自然醫學領域，從基礎實驗研究，到治療及護理研究。中國傳統醫學研究院代表著今天中國最廣泛的學術自然醫學研究。

陰陽

陰陽的概念，源自古代中國人民的自然觀。古人觀察到自然界中各種對立又相聯的大自然現象，如天地、日月、晝夜、暑寒、男女、上下等，以哲學的思想方式，歸納出「陰陽」的概念。早至春秋時代的《易傳》以及老子的《道德經》都有提到陰陽。陰陽理論已經滲透到中國傳統文化的方方面面，包括宗教，哲學，曆法，中醫，書法，建築堪輿，占卜等。陰陽是“對立統一或矛盾關係”的一種劃分或細分，兩者是從屬關係。
陰陽是宇宙中相互關聯的事物或現象對立雙方屬性的概括。最初是指日光的向背，向日光為陽，背日光為陰。陰為“體”，陽為“用”；陰為有形之“體”，陽為無形之“用”。陰陽的交互作用包括：陰陽交感、對立制約、互根互用、消長平衡、相互轉化。

五行

五行學說是中國古代哲學的重要成就，五行即木、火、土、金、水，但是這並不代表五種物質，而是物質的五種屬性。五行於中醫則體現了具備這五種屬性的人體五大系統的相互關係。木火土金水這五個符號分別代表肝心脾肺腎所統領的五大系統。中醫不是研究微觀的病毒細菌如何作用於人體的理論，而是研究人體整體的各個系統之間的關係，並且通過中藥、按摩、針灸，甚至心理作用去調節各個系統之間的平衡，以此保持身體健康。五行的交互作用包括：相生、相剋、制化、勝復、相侮、相乘、母子相及。

氣

在中國的傳統文化，氣是一種積極的原則形成任何有生命的東西的一部分。氣字面翻譯為“呼吸”，“空氣”，或“氣體”，在中醫上被形像地比喻為“材料能源”，“生命的力量”，或者“能量流”。氣是中國傳統醫學與武術中心基本原則。

經絡

經絡是人體運行氣血、聯絡臟腑形體官竅、溝通上下內外的通道。經絡系統包括十二經脈、十二經別、奇經八脈、十五別絡、浮絡、孫絡、十二經筋、十二皮部等。經絡在中醫學的重要性正如《扁鵲心書》所說：“學醫不知經絡，開口動手便錯。蓋經絡不明，無以識病證之根源，究陰陽之傳變。